SARS-COV-2-ը դրական բևեռայնությամբ, չհատվածավորված, գծաձև միաշղթա ՌՆԹ պարունակող պատյանավոր վիրուս է: Պատյանը կրում է Spike (S) սպիտակուցը, որը թիրախային բջջի վրա ճանաչում է ACE2 ընկալիչը և ապահովում վիրուսի ներթափանցումը։ Գենետիկական հսկա բազմազանության հիմքում ընկած են S սպիտակուցի մեծաթիվ մուտացիաները, որոնք ներգրավված են տեսակի պատնեշի հաղթահարման և չեզոքացնող հակամարմիններից խուսափելու գործընթացի մեջ։ Վիրուսի փոխանցման հիմնական եղանակը շնչառականն է։ Վիրուսը սկսում է կրկնապատկվել վարակելուց քսանչորս ժամ հետո, իսկ վիրուսային ՌՆԹ-ն հայտնաբերվում է ուղիղ ախտորոշման մեթոդներով. էտալոնային մեթոդ է համարվում քիթ-ըմպանային նմուշառման ՀՏ-ՊՇՌ-ն։ Սքրինինգն ընդլայնելու նպատակով մշակվել են թքի նմուշառումների ՀՏ-ՊՇՌ և հակագենային թեստեր։ Հիվանդների մեծամասնության մոտ 10-15 օրվա ընթացքում առաջանում են առանձնահատուկ հակամարմիններ, որոնք կարելի է հայտնաբերել շճաբանական մեթոդներով․ խորհուրդ է տրվում համատեղել երկու տիպի`N (նուկլեոկապսիդային) և S սպիտակուցների նկատմամբ հակամարմինների որոնումը։ Վիրուսային գենոմն օժտված է մեծ ճկունությամբ (պլաստիկությամբ), և 2020 թ․ ամառվանից ի հայտ են եկել շտամներ: Գոյություն ունեն մի քանի դասակարգումներ, այդ թվում՝ Առողջապահության համաշխարհային կազմակերպության դասակարգումը, որը յուրաքանչյուր շտամ անվանում է հունարեն տառով: Իսկ «Հանրային առողջություն Ֆրանսիա»-ն գործի է դրել համաճարակաբանական հսկողության համակարգ՝ կիրառելով թիրախային մուտացիաների որոնման և նուկլեոտիդային հաջորդականության որոշման (սեքվենավորում) մեթոդներ։

Le SARS-CoV-2 est un virus enveloppé à ARN monocaténaire linéaire non segmenté de polarité positive. L’enveloppe porte la protéine Spike (S) qui reconnaît le récepteur ACE2 sur la cellule cible et permet l’entrée du virus. Les nombreuses mutations sur la protéine S sont à l’origine d’une grande diversité génétique, impliquées dans le franchissement de la barrière d’espèce et l’échappement aux anticorps neutralisants. Le mode de transmission principal est respiratoire. Le virus réplique dès vingt-quatre heures après l’infection, et l’ARN viral est détecté par les techniques de diagnostic direct; la technique de référence est la RT-PCR sur prélèvement nasopharyngé. Pour élargir le dépistage, la RT-PCR sur prélèvement salivaire et les tests antigéniques ont été développés. La majorité des patients développent des anticorps spécifiques en dix à quinze jours, qui sont détectables par les méthodes sérologiques ; il est recommandé de combiner la recherche des anticorps anti-N (nucléocapside) et anti-S. Le génome viral est doté d’une grande plasticité, et des variants ont émergé dès l’été 2020. Il en existe plusieurs classifications dont celle de l’Organisation mondiale de la santé qui attribue à chaque variant une lettre grecque. Enfin, Santé publique France a déployé un système de surveillance épidémiologique de ces variants à l’aide de techniques de criblage et de séquençage.

SARS-CoV-2 is an enveloped non-segmented linear single-stranded positive RNA virus. The envelope carries the protein spike (S) which recognizes the ACE2 receptor on the target cell and allows entry of the virus. The numerous mutations on the S protein are at the origin of a great genetic diversity, involved in the species barrier and the escape from neutralizing antibodies. The main mode of transmission is respiratory. The virus replicates 24 hours after infection and the viral RNA is detected by direct diagnostic techniques as the reference technique is RT-PCR on a nasopharyngeal sample. To expand screening, RT-PCR on saliva samples and antigenic tests have been developed. The majority of patients develop specific antibodies within 10-15 days which are detectable by serological methods. It is recommended to combine the search for anti-N and anti-S antibodies. The viral genome has great plasticity and variants emerged from the summer of 2020. There are several classifications, including that of the WHO, which assigns each variant a Greek letter. Finally, Santé publique France has deployed an epidemiological surveillance system of variants using PCR screening and sequencing.

Аннотация отсутствует